茜素紅S染色 茜素紅S屬一種蒽醌類(lèi)衍生物，是茜素磺酸鈉鹽，它能與碳酸鈣或磷酸鈣中的鈣鹽螯合形成橙紅色復(fù)合物。一般來(lái)說(shuō)這些染料在識(shí)別中至大量的鈣時(shí)，效果優(yōu)于輕微染色的微量鈣沉積。但茜素紅S往往對(duì)少量的沉積物可得到更可靠的結(jié)果。

尼氏染色，即Nissl染色法，是神經(jīng)生物學(xué)家廣泛使用的一種對(duì)神經(jīng)細(xì)胞的染色方法，用于石蠟或冰凍切片神經(jīng)元細(xì)胞漿中的尼氏小體（Nissl body）染色，在該染色中，尼氏小體清晰可見(jiàn)，可區(qū)分軸突和樹(shù)突等。Nissl染色是以德國(guó)的精神病學(xué)家和神經(jīng)病理學(xué)家Franz Nissl的名字命名的。

甲苯胺藍(lán)染色 甲苯胺藍(lán)（toluidine blue）是常用的人工合成染料的一種，屬于醌亞胺染料類(lèi)，這類(lèi)染料一般含有兩個(gè)發(fā)色團(tuán)，一個(gè)是胺基，一個(gè)是醌型苯環(huán)，來(lái)構(gòu)成色原顯色。染料除有發(fā)色團(tuán)外，還要有能使色原對(duì)組織及其他被染物產(chǎn)生親和力的原子團(tuán)即助色。

阿利新藍(lán)染色（AB-PAS） 正常粘膜上皮能分泌中性和酸性粘液物質(zhì)，中性粘液物質(zhì)含有氨基己糖和游離的己糖基，酸性粘液物質(zhì)也含有氨基己糖并含有各種酸根。此方法先染阿利新藍(lán)將酸性粘液物質(zhì)染為藍(lán)色，并阻斷酸性粘液物質(zhì)中羧酸分子的乙二醇被高碘酸氧化生產(chǎn)二醛與雪夫試劑反應(yīng)而著紅色。只有中性粘液物質(zhì)的乙二醇基被高碘酸生成二醛后與雪夫試劑中的無(wú)色品紅作用生成紅紫色復(fù)合物。

PAS糖原染色 PAS染色法（Periodic Acid-Schiff stain）又稱(chēng)過(guò)碘酸雪夫染色、糖原染色。在組織學(xué)上，主要用來(lái)檢測(cè)組織中的糖類(lèi)，一般用來(lái)顯示糖元和其它多糖物質(zhì)。過(guò)碘酸把糖類(lèi)相鄰兩個(gè)碳上的羥基氧化成醛基，再用Schiff試劑和醛基反應(yīng)使呈現(xiàn)紫紅色。

天狼猩紅（Picrosirius Red ）染色可用于區(qū)分Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型膠原，由于天狼猩紅是一種強(qiáng)酸性陰離子染料，可與呈堿性的膠原反應(yīng)，使膠原纖維在偏振光照射時(shí)，產(chǎn)生明顯的雙折光現(xiàn)象。不同的膠原纖維具有不同的旋光性，在偏振光顯微鏡下呈現(xiàn)相異的顏色，借以區(qū)分Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型膠原，Ⅰ型纖維：緊密排列， 顯示很強(qiáng)的雙折光性